Dalam hasil investigasi yang diprakarsai oleh BP2MI dan telah diserahkan kepada Mahfud MD selaku Menko Polhukam, diduga pelaku dengan sengaja menenggelamkan salah satu perahu agar tidak tertangkap oleh aparat penegak hukum.
Setelah berhasil menarik perhatian aparat, pelaku langsung meloloskan perahu lainnya yang diduga penumpangnya lebih banyak dibanding perahu yang karam.
Pekerja migran ini diduga tidak mempunyai dokumen yang sah.
Selain Batam, ada beberapa daerah lainnya di Indonesia yang sering terjadi kasus pekerja migran yang tewas di dalam perahu yang tenggelam.
Daerah yang dimaksud yaitu Nusa Tenggara Timur, Nusa Tenggara Barat, Jawa Timur, Jawa Tengah.